Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCLP19338 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCLP19338 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCLP19338 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCLP19338 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCLP19338 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCLP19338 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCLP19338 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCLP19338 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCLP19338 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCLP19338 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCLP19338 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCLP19338 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCLP19338 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCLP19338 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCLP19338 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCLP19338 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCLP19338 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCLP19338 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCLP19338 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCLP19338 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCLP19338 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCLP19338 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCLP19338 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCLP19338 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCLP19338 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCLP19338 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCLP19338 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCLP19338 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NCLP19338 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCLP19338 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCLP19338 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCLP19338 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms