Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DESP17661 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DESP17661 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DESP17661 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DESP17661 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DESP17661 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DESP17661 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DESP17661 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DESP17661 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DESP17661 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DESP17661 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DESP17661 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DESP17661 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DESP17661 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DESP17661 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DESP17661 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DESP17661 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DESP17661 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DESP17661 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DESP17661 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DESP17661 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DESP17661 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DESP17661 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DESP17661 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DESP17661 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DESP17661 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DESP17661 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms