Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD46P15529 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD46P15529 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD46P15529 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD46P15529 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD46P15529 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD46P15529 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD46P15529 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD46P15529 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD46P15529 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD46P15529 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD46P15529 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD46P15529 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD46P15529 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD46P15529 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD46P15529 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD46P15529 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD46P15529 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD46P15529 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD46P15529 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD46P15529 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD46P15529 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD46P15529 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD46P15529 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD46P15529 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD46P15529 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD46P15529 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD46P15529 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD46P15529 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD46P15529 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms