Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms