Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms