Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD8BP10966 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms