Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP10P09238 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP10P09238 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP10P09238 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP10P09238 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP10P09238 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP10P09238 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP10P09238 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP10P09238 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP10P09238 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP10P09238 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP10P09238 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP10P09238 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP10P09238 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP10P09238 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP10P09238 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP10P09238 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP10P09238 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP10P09238 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP10P09238 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP10P09238 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms