Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTSLP07711 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTSLP07711 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTSLP07711 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTSLP07711 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTSLP07711 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSLP07711 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSLP07711 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSLP07711 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSLP07711 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSLP07711 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSLP07711 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSLP07711 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSLP07711 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSLP07711 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSLP07711 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSLP07711 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSLP07711 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSLP07711 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms