Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLBP06746 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLBP06746 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLBP06746 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLBP06746 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLBP06746 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLBP06746 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLBP06746 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLBP06746 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLBP06746 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLBP06746 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLBP06746 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLBP06746 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLBP06746 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLBP06746 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLBP06746 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLBP06746 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLBP06746 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLBP06746 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLBP06746 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLBP06746 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLBP06746 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLBP06746 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLBP06746 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLBP06746 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLBP06746 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLBP06746 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLBP06746 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLBP06746 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLBP06746 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLBP06746 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLBP06746 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLBP06746 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLBP06746 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLBP06746 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLBP06746 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLBP06746 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLBP06746 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLBP06746 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLBP06746 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLBP06746 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLBP06746 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms