Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP19O94966 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP19O94966 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP19O94966 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP19O94966 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP19O94966 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP19O94966 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP19O94966 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP19O94966 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP19O94966 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP19O94966 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP19O94966 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP19O94966 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP19O94966 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP19O94966 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP19O94966 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP19O94966 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP19O94966 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP19O94966 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP19O94966 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP19O94966 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP19O94966 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP19O94966 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP19O94966 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP19O94966 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP19O94966 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP19O94966 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP19O94966 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP19O94966 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP19O94966 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP19O94966 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP19O94966 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP19O94966 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP19O94966 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms