Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRMUO75648 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRMUO75648 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRMUO75648 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRMUO75648 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRMUO75648 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRMUO75648 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRMUO75648 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRMUO75648 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRMUO75648 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRMUO75648 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRMUO75648 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRMUO75648 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRMUO75648 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRMUO75648 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRMUO75648 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRMUO75648 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRMUO75648 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRMUO75648 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRMUO75648 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRMUO75648 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRMUO75648 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRMUO75648 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRMUO75648 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRMUO75648 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms