Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF5BO60841 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms