Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DENRO43583 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DENRO43583 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms