Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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HOXA3O43365 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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HOXA3O43365 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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HOXA3O43365 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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HOXA3O43365 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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HOXA3O43365 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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HOXA3O43365 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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HOXA3O43365 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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HOXA3O43365 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXA3O43365 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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