Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms