Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
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