Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms