Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms