Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IQCJ-SCHIP1C9J366 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms