Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms