Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LINC00587B1AMM8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LINC00587B1AMM8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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LINC00587B1AMM8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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LINC00587B1AMM8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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LINC00587B1AMM8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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LINC00587B1AMM8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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LINC00587B1AMM8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LINC00587B1AMM8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LINC00587B1AMM8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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LINC00587B1AMM8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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