Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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