Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB13A6NJU9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms