Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
A4D1N5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
A4D1N5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
A4D1N5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms