Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms