Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J9

TAF6L, TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6LQ9Y6J9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6LQ9Y6J9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6LQ9Y6J9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms