Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms