Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms