Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCQ9Y266 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCQ9Y266 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms