Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms