Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms