Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms