Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms