Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZMYND8Q9ULU4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZMYND8Q9ULU4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms