Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms