Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms