Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms