Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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