Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms