Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms