Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms