Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms