Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOR4AQ9NXH8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms