Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX14

NDUFB11, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB11Q9NX14 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFB11Q9NX14 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms