Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms