Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms