Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RTN4Q9NQC3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN4Q9NQC3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms