Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms