Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAF1Q9H7N4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF1Q9H7N4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms