Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms